万方查重是指利用万方数据库进行文献查重，主要用于学术论文查重和学术不端查重。通过万方查重可以检测论文的重复率，避免学术不端行为的发生。而学术不端查重是指针对学术界存在的抄袭、剽窃等不端行为进行查重检测，保障学术诚信。

万方查重主要侧重于文献查重，即检测论文是否存在抄袭行为，保障学术论文的原创性和学术诚信。而学术不端查重则更广泛，不仅包括文献查重，还包括对学术不端行为的查处和预防，维护学术界的规范秩序和学术道德。两者都是为了促进学术研究的健康发展和学术诚信的建设。