学术不端查重是指对学术论文、科研成果等进行查重，主要目的是检测文献中是否存在抄袭或剽窃现象。通常采用的工具有Turnitin、iThenticate等，能够比对全球范围内的文献数据库，准确度较高。而学校的查重则是指学校教师对学生提交的作业、论文进行查重，主要目的是检测学生是否存在抄袭行为。学校一般会提供自己的查重系统，如知网查重系统、学术乌鸦等，用于检测学生的学术诚信情况。

除了目的不同外，学术不端查重和学校的查重在方式上也有所区别。学术不端查重通常由专业的编辑人员或机构进行，操作相对复杂，需要一定的专业知识。而学校的查重则更注重操作简便性和实用性，通常教师可以自行操作，无需专业知识。此外，学术不端查重的应用领域更广泛，涵盖科研机构、出版社等领域，而学校的查重主要应用于教育领域，用于维护学术诚信和教学质量。