学术不端查重是指检测学术论文中是否存在抄袭行为的过程，通常用于保证学术研究的真实性和原创性。而知网查重是指利用知网等专业学术数据库进行查重，主要用于检测学术论文的引用和重复率。两者的区别在于前者侧重于抄袭行为的检测，后者侧重于文献引用和重复率的检测。

此外，学术不端查重通常采用专门的查重软件，如Turnitin、iThenticate等；而知网查重则是利用知网等学术数据库的查重功能进行检测。在实际应用中，学术不端查重更注重学术道德和学术规范的维护，而知网查重更注重学术文献的质量和原创性。因此，两者虽然都是查重工具，但在应用场景和侧重点上有所不同。